Responsables :
Mélissa PALOS-LADEIRO (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Séverine PARIS (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	20h	5h	15h	40h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	CRTP	CRTP	EET	EET	Total
		Durée				1h	1h
Points	Cas général	1ère session	20	20	20	40	0	100%
		2ème session	20	20	20	0	40	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	20	20	20	40	0	100%
		2ème session	20	20	20	0	40	100%

Objectifs :
Connaitre les grandes caractéristiques morphologiques et anatomiques de différents groupes d?invertébrés.
Compétences spécifiques visées :
Maîtriser la classification et l?organisation biologique chez les invertébrés. Connaissances des relations entre la structure et la fonction de grands processus physiologiques.
Compétences générales visées :
Maîtriser les techniques d?observation des organismes. Synthétiser des idées par écrit avec les comptes rendus.
Connaissances requises :
Notions de biologie animale acquises en 1ere année de Licence ( #BA0201 Introduction à la diversité du monde animal).

Programme :
Cours magistraux :Présentations des principales caractéristiques morphologiques et anatomiques des représentants des différents groupes zoologiques suivants : Echinodermes, Annélides, Mollusques, Insectes, Arachnides, Crustacés (en se basant sur l?étude de quelques organismes représentatifs).Connaissance des services écosystémiques apportés par les organismes invertébrés (recherche scientifique, éthique, écologie, qualité des milieux, etc.)Travaux dirigés et pratiques :Les séances de TD sont associées au séances de TP.Dans un premier temps, les travaux dirigés conduisent l?étudiant à une réflexion concernant les caractéristiques anatomo-morphologiques propres à chaque groupe étudiés.Dans un second temps, les travaux pratiques consistent en des observations d?espèces appartenant aux différents groupes étudiés en TD qui permettra d?établir d?une ébauche de classification des groupes zoologiques concernés à-partir des caractéristiques spécifiques de chaque groupe.

Responsables :
Aurélie BIGOT-CLIVOT (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	Total
Durée	11h	9h	20h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	EET	EET	Total
		Durée	1h	1h30	1h30
Points	Cas général	1ère session	30	70	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
Acquérir des connaissances sur le fonctionnement et l?évolution de la biosphère.
Compétences spécifiques visées :
Définition et gestion de la biodiversité. Maitriser les concepts d?interactions et de flux d?énergie au sein des écosystèmes.
Compétences générales visées :

Connaissances requises :
Les notions d?écologie des milieux terrestres et aquatiques abordées en première année de Licence #ECO0102

Programme :
Cours magistraux :- Mise en place et évolution de la biosphère- Cycles biogéochimiques- Flux d?énergie- Interactions entre organismes (symbiose, prédation, compétition, parasitisme)- Biodiversité : définitions, facteurs de régulation, causes de la perte de la biodiversité.- La mécanique de la sélection naturelle, étude de casTravaux dirigés :- Un exemple d?application de l?écologie : la lutte biologique contre les ravageurs des cultures- Les réseaux trophiques et le flux d?énergie- Les indices de biodiversité

Responsables :
Emmanuelle DEVARENNE-CHARPENTIER (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Hervé SARTELET (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	20h	14h	6h	40h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	DS	DS	EET	EET	Total
		Durée		1h	1h	2h	2h
Points	Cas général	1ère session	20	15	15	50	0	100%
		2ème session	20	0	0	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Connaître les principales voies du catabolisme des glucides et des lipides
Compétences spécifiques visées :
Localiser et connaitre la régulation du catabolisme des glucides et des lipides
Compétences générales visées :
Connaitre les principaux cycles métaboliques
Connaissances requises :
Connaître les structures et les propriétés des molécules biologiques

Programme :
Cours magistrauxIntroduction au métabolismeGlycolyse et fermentationCycle de Krebs et cycle de CalvinBeta oxydation et biosynthèse des acides grasLa phosphorylation oxydativeTravaux dirigés :Exercices d?application du coursTravaux-Pratiques :Régulation de l?activité de la succinate déshydrogénaseEtude de la glycolyse

Responsables :
Sandrine BOUQUILLON (Responsable) - département Chimie (UFR SEN)
Eric HENON (Responsable) - département Chimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	Total
Durée	12h	8h	20h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	EET	EET	Total
		Durée	0h45	2h	2h
Points	Cas général	1ère session	30	70	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
Présentation de la stéréochimie, des notions d?effets électroniques et de mésomérie.Etendre les connaissances de Chimie acquises au lycée dans le domaine des réactions de transfert d'électrons (oxydation, réduction). Application aux réactions du métabolisme.
Compétences spécifiques visées :
Acquérir des connaissances en stéréochimie sur des molécules organiques simples et complexes et sur des molécules du vivant.Compréhension des effets électroniques inductifs et mésomères.Savoir déterminer et suivre l'évolution du degré d'oxydation d'un élément chimique dans un composé organique au cours d'une réaction. Calculer le potentiel d'un couple Rédox à partir de l'équation de Nernst dans les conditions biologiques standards et dans les conditions réelles. Savoir équilibrer une réaction Rédox.
Compétences générales visées :
Maîtrise des différents aspects de la stéréochimie et compréhension de son importance.Comprendre l'origine des processus de transfert d'électrons dans les réactions du métabolisme et prédire le sens d'évolution spontané d'une réaction d'oxydoréduction.Prévision des caractères acide/base de composés définis.Notions sur la réactivité au travers des effets électroniques.
Connaissances requises :
Bases de chimie générale et organique enseignées en S1

Programme :
Cours magistraux :Isomérie de constitution (isomérie de chaîne, isomérie de position, isomérie de fonction)Stéréoisomérie (carbone asymétrique, chiralité, configurations R et S, configurations Z et E, notions de pouvoir rotatoire et de mélange racémique)Degré d'oxydation, oxydation, réduction, demi-réaction, potentiel (Nernst), Echelle des potentiels,potentiel standard biologiqueRéaction d'oxydo-réduction, équilibrer une réaction, prévision du sens spontané d'une réaction redoxTravaux dirigés:Illustration du cours sous forme d?exercicesInitiation à la réactivitéAutoFormation (AF) : Ce contenu est accompagné d'une autoformation proposée aux étudiants sous la forme d'une série de tutoriels vidéo consultables en ligne. Ces séquences vidéo reprennent en partie les éléments de cours et la pratique de résolution d'exercices pour renforcer et améliorer l'efficacité de l'apprentissage.

Responsables :
Céline SCHNEIDER (Responsable) - département Sciences de la Terre (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	15h	6h	9h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	IE	CRTP	EET	EET	Total
		Durée	0h15		2h	2h
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	0	20	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Comprendre les processus qui conduisent à la formation des roches sédimentaires et les grands principes de la stratigraphie.
Compétences spécifiques visées :
Compréhension de la formation des couches sédimentaires ; observation et description des roches et minéraux en microscopie optique.
Compétences générales visées :
Acquisition des bases en stratigraphie et maîtrise des outils en géologie (microscope).
Connaissances requises :
Licence SVT première année

Programme :
Cours magistraux :Processus de formation des roches sédimentaires, milieux de sédimentation.Bases de la stratigraphie (principes de bases & méthodes d?études des ensembles sédimentaires).L?échelle des temps géologiques : élément-clef pour comprendre les étapes de l?histoire de la Terre.Travaux pratiques :Reconnaissance des roches sédimentaires : caractérisation macroscopique et microscopie optique.Base de paléontologie et de biostratigraphie.

Responsables :
Angélique GAINVORS-CLAISSE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Sabine GOGNIES (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	12h	8h	10h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	DS	DS	EET	EET	Total
		Durée		1h	1h	1h30	1h30
Points	Cas général	1ère session	20	15	15	50	0	100%
		2ème session	30	0	0	0	70	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Renforcer les bases fondamentales de la microbiologie
Compétences spécifiques visées :
Le programme vise à élargir les connaissances de l?étudiant sur le monde microbien (bactéries, mycètes). Au terme de cet enseignement, l?étudiant sera susceptible d?isoler et d?identifier une bactérie. Il sera en mesure d?évaluer également sa croissance
Compétences générales visées :
Analyser, interpréter et restituer des résultats expérimentaux. Acquérir les gestes spécifiques à la microbiologie (travail en conditions stériles, observations microscopiques, mises en culture, gestion des déchets microbiologiques)
Connaissances requises :

Programme :
COURS? Bactériologie générale : Taxonomie, Nutrition, Transport et Croissance? Mycologie générale : Structure et physiologie des levures, Généralités sur les mycètes,? Etude de divers groupes microbiens (comparaison des structures : paroi, membrane?)TRAVAUX DIRIGES? Méthodes d?identification d?une bactérie? Croissance microbienneTRAVAUX PRATIQUES? Observations microscopiques : bactéries - colorations simples et différentielles? Mises en culture? Dénombrement, établissement d?une courbe de croissance (E.coli)? Identification d?une bactérieAUTOFORMATION? Recherche d?informations sur les milieux d?identification et les techniques de dénombrement.? Etablir les protocoles de TP sous forme de schémas? S?évaluer par l?intermédiaire de tests en ligne

Responsables :
Françoise HERDENBERGER (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Sébastien BLAISE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	20h	4h	6h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	DS	EET	EET	Total
		Durée	0h45	0h45	1h	1h
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Acquérir des connaissances sur différents aspects de la fonction de nutrition
Compétences spécifiques visées :
Maîtriser la notion de système, ensemble d?organes assurant la même fonction, et savoir intégrer les différentes échelles d?étude d?un organisme animalSavoir mettre en ?uvre un protocole expérimental assisté par ordinateur
Compétences générales visées :
Comprendre une démarche scientifique et expérimentale visant à répondre à une question concrèteSavoir analyser et interpréter des résultats expérimentaux.
Connaissances requises :

Programme :
Cours :? Alimentation et digestion? Respiration? Circulation? Approche métabolique et carrefours métaboliquesTravaux dirigés :? Exercices d?application du coursTravaux pratiques :? Etude du quotient respiratoire? Anatomie et histologie des principales structures du système cardiovasculaire, de l?appareil respiratoire et du système digestif

Responsables :
Sandrine DHONDT-CORDELIER (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Aurore ANDRÉ (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	6h	8h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	CRTP	IE	DS	EET	EOT	Total
		Durée			0h10	0h30	1h	0h20
Points	Cas général	1ère session	12.5	12.5	5	20	50	0	100%
		2ème session	12.5	12.5	0	0	0	75	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	15	15	0	0	70	0	100%
		2ème session	15	15	0	0	0	70	100%

Objectifs :
Connaissances de la physiologie et des métabolismes végétaux
Compétences spécifiques visées :
Utilisation et devenir de l?eau et des minéraux par la plante. Absorption, circulation des sèves, transpiration, stomate, adaptation des plantes à des milieux extrèmes.
Compétences générales visées :
Interpréter des données expérimentales (TP, documents), acquérir de l?autonomie et de la rigueur dans le travail. Savoir utiliser le matériel communément utilisé dans un laboratoire.
Connaissances requises :
enseignement de la Terminale S, Sciences de la Vie et de la Terre #CHIM0101 #PHYS0101 #BCPV0201

Programme :
COURS :Physiologie des organes végétatifs (racines, tiges, feuilles) des Angiospermes : la nutrition des plantes à fleurs.- La nutrition hydrique- La nutrition minéraleTRAVAUX PRATIQUES :- Nutrition hydrominérale de la plante- Les ions minéraux azotés dans la planteTRAVAUX DIRIGES :- Exercices portant sur le cours- Préparation à l?écrit

Responsables :
Jessica JONQUET (Responsable) - département Informatique (UFR SEN)
Philippe REGNAULT (Responsable) - département Mathématiques (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	TP	Total
Durée	12h	12h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CR	ITP	ITP	Total
		Durée
Points	Cas général	1ère session	30	52.5	17.5	100%
		2ème session	30	52.5	17.5	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	30	52.5	17.5	100%
		2ème session	30	52.5	17.5	100%

Objectifs :
Maîtriser les outils de bureautiques avancées dans le but de la réalisation de statistiques descriptives.
Etre responsable et organiser sa recherche d'informations à l'ère du numérique. Travailler en réseau avec des collaborateurs sur des documents numériques.
Compétences spécifiques visées :
Maîtrise d'un outil de travail collaboratif et être responsable face aux réglementations pour l'utilisation de ressources numériques.
Savoir présenter un fichier de données en vue de son analyse statistique dans un logiciel de type tableur (Excel).
Savoir résumer (répartition, indices de position, de dispersion) et représenter des données qualitatives ou quantitatives à l'aide d'un tableur.
Compétences générales visées :
Informatique générale
Connaissances requises :

Programme :
Être responsable face aux réglementations concernant l'utilisation de ressources numériques : utilisation des documents en provenance du net de manière correcte (libre de droit ou utilisable avec obligation de citation).
Organiser la recherche d'information : récupérer et référencer une ressource numérique en ligne (veille informationnelle).
Travailler en réseau avec des collaborateurs : élaborer une production dans un contexte collaboratif (corrections et annotations de documents).

Fonctionnalités élémentaires d'un tableur : copie vers le bas, formules, utilisation des fonctions logiques et mathématiques.
Statistiques descriptives : rappel sur le vocabulaire des statistiques descriptives, distribution d'une variable quantitative, indices de position et de dispersion, diagrammes en barres, circulaires, profils, histogrammes, boîtes à moustaches.
Représentations graphiques avec un tableur.

Responsables :
Aurore ANDRÉ (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Vincent BANCHET (Responsable) - département Physique (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	Total
Durée	11h	4h	15h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	Stage	EET	EET	Total
		Durée		1h	1h
Points	Cas général	1ère session	20	80	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
Sensibilisation aux métiers de l'enseignement.
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :
Connaissances des métiers de l'enseignement.
Connaissances requises :
Aucune

Programme :
Cet enseignement est proposé à des étudiants motivés, désirant plus tard enseigner dans les écoles maternelles ou primaires, les collèges ou lycées et qui souhaitent intégrer l'ESPE. L'objectif est de mettre en contact le stagiaire avec le milieu éducatif, de lui faire découvrir sa structure, son fonctionnement, son évolution, le fonctionnement d'un établissement et la mise en place de ses projets pédagogiques.

L'enseignement comporte :
1) des cours portant sur le système éducatif (primaire et secondaire), le métier d'enseignant et la pratique de l'enseignement.

2) un stage en situation : l'étudiant est affecté à un établissement, école, collège ou lycée (de préférence dans une discipline particulière) dans le cadre d'une convention.

3) une évaluation en 2 parties : a) par le chef d'établissement d'accueil ou le directeur d'école (assiduité, ponctualité, présentation, participation, ...) b) écrit portant sur les cours et la mise en adéquation du stage par rapport aux cours

La plupart des interventions est assurée par des professionnels de l'enseignement.

Responsables :
Thierry CÔME (Responsable) - département STAPS (UFR SEN)
Laurent MARTINY (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	Total
Durée	12h	12h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	EET	EET	Total
		Durée	1h30	1h30
Points	Cas général	1ère session	100	0	100%
		2ème session	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	100	0	100%
		2ème session	0	100	100%

Objectifs :
Comprendre les mécanismes économiques et juridiques ainsi que le fonctionnement des entreprises
Comprendre la spécificité des métiers liés à la recherche
Compétences spécifiques visées :
Maitriser des outils théoriques afin de conduire une réflexion économique et/ou managériale
Compétences générales visées :
Savoir poser une problématique relative à une question
Connaissances requises :
Aucune

Programme :
- Droit.
- Analyses économiques.
- L'entreprise : une organisation économique et sociale.
- Le management stratégique d'entreprise.
- La fonction commerciale / Marketing de l'entreprise.
- Economie et gestion d'entreprise.

Responsables :
Jessica THEVENARD-DEVY - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Fabienne BAILLIEUL - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Maxime GOMMEAUX - département Sciences de la Terre (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TP	Total
Durée	3h	19h	22h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CR	Oral	EOT	DO	Total
		Durée		0h20	0h20
Points	Cas général	1ère session	50	50	0	0	100%
		2ème session	0	0	50	50	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	50	50	0	0	100%
		2ème session	0	0	50	50	100%

Objectifs :
Permettre de valider un stage, de mettre en pratique ses connaissances théoriques et de connaitre le monde de l'entreprise
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :
Connaissance du monde professionnel
Connaissances requises :

Programme :
L'objectif de cette unité d'enseignement est d'inciter les étudiants à découvrir le monde professionnel pendant leur cursus de licence, en réalisant un stage qu'ils auront eux même trouvé.
Il doit se dérouler sur au moins 4 semaines à temps plein pendant des vacances ou sur toute durée équivalente à temps partiel.
L'évaluation de l'unité d'enseignement se fera sur un rapport écrit d'une trentaine de pages et un exposé oral présentant le sujet scientifique associé au travail effectué (sur les 2 sessions).

Important :
Une réunion d'information a lieu en début d'année universitaire.
Pour pouvoir s'inscrire à cette unité, l'étudiant doit avoir établi une convention de stage.
Les étudiants voulant anticiper le stage (par exemple en été) doivent prendre contact avec le responsable de l'EC suffisamment tôt pour pouvoir établir une convention.
La définition du sujet se fait en accord avec le responsable de l'EC en rapport avec le travail confié au stagiaire. Ceci soit après la première réunion, soit sur rendez-vous avec le responsable de l'EC (anticipé).
Pour que l'inscription soit effective, le stage devra être validé par le responsable de l'EC et un enseignant de la licence SVT en devient le garant. Le stage devra être en lien avec le projet professionnel de l'étudiant et son cursus universitaire.

Responsables :
Annabelle BULIN (Responsable) - département Langues (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	TD	Total
Durée	12h	12h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	IE	Projet	EET	Total
		Durée	0h40	12h	0h40
Points	Cas général	1ère session	75	25	0	100%
		2ème session	0	25	75	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	75	25	0	100%
		2ème session	0	25	75	100%

Objectifs :

Consolider son niveau en langue anglaise.

Compétences spécifiques visées :

Travail approfondi en présentiel sur l?expression écrite. Travail en autonomie sur les compétences de réception (compréhension de l?oral et de l?écrit), sur la grammaire, le vocabulaire et la phonologie. 

Compétences générales visées :

Niveau B2 du cadre Européen Commun de Référence pour les Langues en fin de licence (compréhension de l?oral et de l?écrit, expression orale en continu et en interaction et expression écrite).
« Peut comprendre le contenu essentiel de sujets concrets ou abstraits dans un texte complexe, y compris une discussion technique dans sa spécialité. Peut communiquer avec un degré de spontanéité et d'aisance tel qu'une conversation avec un locuteur natif ne comportant de tension ni pour l'un ni pour l'autre. Peut s'exprimer de façon claire et détaillée sur une grande gamme de sujets, émettre un avis sur un sujet d?actualité et exposer les avantages et les inconvénients de différentes possibilités. »
Conseil de l'Europe (2001). Cadre européen commun de référence pour les langues ? Apprendre, enseigner, évaluer. Paris : Didier.

Connaissances requises :

Apprentissage de la langue anglaise dans l?enseignement secondaire et supérieur. 

Programme :

Suite à son test de positionnement, l?étudiant travaillera en présentiel dans un groupe correspondant à son niveau et à ses objectifs de progression (travail vers B1, travail vers B2 ou travail vers C). 

Volume horaire non présentiel : En complément des TD, un travail en hors présentiel devra être effectué sur une plateforme de travail et/ou au Centre de Ressources en Langues (CRL), selon les consignes qui seront données par l'équipe pédagogique. Il représentera également un volume de 12h et sera évalué dans le cadre d?une note de projet. 

Responsables :
Marie-Pierre COURAGEOT (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Stéphanie SALESSE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	14h	12h	4h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	DS	DST	EET	Total
		Durée	1h	0h30	2h	1h
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	20	80	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Donner aux étudiants une vue générale des problèmes relatifs à la transmission des caractères héréditaires ; comprendre pourquoi et comment nous ressemblons ou ne ressemblons pas à nos ascendants; maîtriser le vocabulaire, les définitions et la nomenclature utilisés en Génétique « classique ». Par les raisonnements logiques qu?elle implique, cette discipline, particulièrement formatrice est toujours d?actualité parallèlement à l?essor prodigieux pris de nos jours par la génétique moléculaire.
Compétences spécifiques visées :
Connaître les fondements de la transmission de mendélienne. Comprendre comment cette transmission peut être influencée pour former des exceptions apparentes ou vraies aux lois de Mendel. Appréhender et comprendre l?hérédité extra-nucléaire
Compétences générales visées :

Connaissances requises :
Programme de Terminal S en génétique Mendelienne et notions de génétique moléculaire abordées en #GENM0201

Programme :
COURS :- Mitose, Méiose, Cycles Biologiques.- Génétique Formelle : Lois de Mendel. Gènes liés. Gènes interactifs. Gènes létaux. Linkage. Liaison au sexe.- Génétique extra- nucléaireTRAVAUX DIRIGES :- Exercices d?application du coursTRAVAUX PRATIQUES :- Etude de la méiose chez divers organismes modèles- Observation de la transmission de caractères chez la Drosophile

Responsables :
Bertrand BRASSART (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Aline BENNASROUNE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	18h	8h	4h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	ITP	EET	EET	Total
		Durée	0h50	0h10	1h40	1h40
Points	Cas général	1ère session	20	10	70	0	100%
		2ème session	0	10	0	90	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	10	90	0	100%
		2ème session	0	10	0	90	100%

Objectifs :
- Découvrir l'immunologie et avoir une première vue d'ensemble du système immunitaire- Acquérir les connaissances nécessaires à la compréhension du fonctionnement des systèmes de défense au niveau moléculaire (antigènes, récepteurs BcR ? TcR, co-récepteurs, produits des CMH).
Compétences spécifiques visées :
- Découverte et apprentissage de techniques immunologiques- Maitriser les concepts d'anticorps et d'antigènes
Compétences générales visées :

Connaissances requises :
Programme d?immunologie de Terminale S

Programme :
CM :- Vue d?ensemble du Système Immunitaire : historique et concepts- Cellules, organes et microenvironnements du Système Immunitaire- Récepteurs et signalisation : le BcR, le TcR, les cytokines et les chimiokines- L?immunité innée- Le système du complément- L?immunité adaptative : récepteurs de l?Antigène et CMH- Les méthodes expérimentales- Notions de défense chez les VégétauxTD :Exercices d?applications du cours : Notions d'antigènes et d'anticorps ; La réaction antigène-anticorps ; Les techniques immunologiquesTP :- Etude d'un organe lymphoïde secondaire : la rate- Immunoprécipitation en milieu gélosé

Responsables :
Françoise HERDENBERGER (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Franck DARGENT (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Katia SAVARY - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	18h	6h	6h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	DS	EET	EET	Total
		Durée	0h45	0h45	1h	1h
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%

Objectifs :
? Connaître et comprendre le fonctionnement de cellules excitables : les cellules nerveuses et les cellules musculaires
Compétences spécifiques visées :
? Maîtriser les bases de la communication intercellulaire? Savoir intégrer les différentes échelles d?étude d?un organisme animal
Compétences générales visées :
? Comprendre une démarche scientifique et expérimentale visant à répondre à une question concrète? Savoir analyser, interpréter et restituer des résultats expérimentaux
Connaissances requises :

Programme :
Cours :? Neurones : structure, potentiel de repos, potentiel d?action, message nerveux? Synapses : structure et transmission synaptique? Cellules musculaires : structure, contraction musculaire, couplage excitation-contraction, métabolisme énergétiqueTravaux dirigés :? Exercices d?application du cours? Compléments de coursTravaux pratiques :? Etude des potentiels complexes (réponse électrique du nerf et du muscle)? Etude de la contraction musculaire

Responsables :
Aurore ANDRÉ (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Sandrine DHONDT-CORDELIER (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	6h	8h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	IE	CRTP	DS	EET	EET	Total
		Durée	0h10		0h30	1h	1h
Points	Cas général	1ère session	5	25	20	50	0	100%
		2ème session	0	25	0	0	75	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	30	0	70	0	100%
		2ème session	0	30	0	0	70	100%

Objectifs :
connaissance de la physiologie et des métabolismes végétaux
Compétences spécifiques visées :
pouvoir analyser correctement des données expérimentales traitant de l?utilisation de l?azote du sol et de l?atmosphère, de la photosynthèse, la photorespiration et de l?hétérotrophie chez les plantes. Savoir extraire des pigments et faire un suivi expérimental de la photosynthèse.
Compétences générales visées :
analyse de documents, interprétations de données expérimentales, acquérir autonomie et rigueur dans le travail de TP, savoir utiliser le matériel usuel de laboratoire
Connaissances requises :
SVT terminale S, #BCPV0201 #CHIM0101 #BIOCH0301 #PHYV0301

Programme :
COURSPhysiologie des organes végétatifs (racines, tiges, feuilles) des Angiospermes : la nutrition des plantes à fleurs.- La nutrition azotée- La nutrition carbonéeTRAVAUX PRATIQUES- Nutrition carbonée : les pigments photosynthétiques- Nutrition carbonée : suivi de la photosynthèse par la réaction de HillTRAVAUX DIRIGES- Exercices portant sur le cours- Préparation à l?écrit

Responsables :
Hassan EL BTAOURI (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Laurent DUCA (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Gustave AGUIE-AGUIE (Responsable)
Béatrice ROMIER-CROUZET (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	14h	10h	6h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	DS	EET	EET	Total
		Durée		1h	2h	2h
Points	Cas général	1ère session	20	30	50	0	100%
		2ème session	20	0	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Acquérir les notions de base de l?enzymologie et de la bioénergétique
Compétences spécifiques visées :
Savoir doser une activité enzymatique, déterminer les paramètres cinétiques de l?enzyme, et définir les types d?inhibition.
Compétences générales visées :
Apprentissage de la manipulation des enzymes.
Connaissances requises :

Programme :
Cours :Cinétique chimique.Notion d?ordre et de couplage bioénergétique de la réactionRôles et propriétés des enzymes: notion du site actif ? affinitéCinétique michaelienne : équation et constantes de Michaelis?MentenLes divers types d?inhibiteurs, détermination de Ki.TD :Exercices d?application directe du cours.TP :- Etude de la β-galactosidase. Détermination de : KM ? Vmax - Constante catalytique - Activité spécifique- Inhibition de la β-galactosidase. Représentation de Dixon ? Détermination de KI

Responsables :
Frédéric DELACOUX (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Stéphane DEDIEU (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Béatrice ROMIER-CROUZET - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	10h	4h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	DS	DS	EOT	EET	Total
		Durée		1h	1h	0h15	2h
Points	Cas général	1ère session	20	40	40	0	0	100%
		2ème session	20	0	0	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	20	0	0	80	0	100%
		2ème session	20	0	0	0	80	100%

Objectifs :
Maîtriser les bases fondamentales de la biologie moléculaire.
Compétences spécifiques visées :
Maîtriser la technique de PCR d?un point de vue théorique et pratique
Compétences générales visées :
Appréhender le travail sur les acides nucléiques
Connaissances requises :

Programme :
COURS- Structure et propriétés physico-chimiques des acides nucléiques- Méthodes d?études des acides nucléiques et leurs applications (les puces à ADN, l?utilisation de sondes moléculaires, les différentes PCR?)- Biotechnologies (clonage et banque d?ADN, détection d?OGM...)TRAVAUX DIRIGES- Exercices d?application- Compléments de coursTRAVAUX PRATIQUES- Extraction et purification d?ADN plasmidique et mise au point de conditions optimales pour une PCR

Responsables :
Stéphane DEDIEU (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Frédéric DELACOUX (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	Total
Durée	20h	10h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	Oral	EET	EET	Total
		Durée	1h	1h	1h
Points	Cas général	1ère session	50	50	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
Définir les différentes biotechnologies et appréhender les enjeux technologiques et sociétaux associés.
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :
Recommandé pour les Master en Biotechnologie et/ou Biologie-Santé
Connaissances requises :

Programme :
COURS :- Présentation des différentes biotechnologies- Appréhender les enjeux scientifiques, technologiques, économiques et sociétaux associés.- Focus sur les retombées en Santé.TD :- Travail en groupe et présentation d?un sujet lié aux biotechnologies

Responsables :
Christelle OUDOT-DELACOUX (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Michel TARPIN (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	10h	4h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	DS	DS	EET	EET	Total
		Durée	0h45	0h45	0h15	1h	1h
Points	Cas général	1ère session	20	20	10	50	0	100%
		2ème session	20	20	10	0	50	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Apporter aux étudiants les éléments fondamentaux de cytogénétique afin de comprendre le rôle des chromosomes et de leur transmission dans les anomalies génétiques. Les chromosomes étant le support des gènes. Les étudiants aborderont la génétique et l?évolution des populations qui ont pour objectifs principaux l?étude des fréquences alléliques et génotypiques et la stabilité et l?évolution de la diversité génétique au cours des générations successives.
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :
-Comprendre le rôle des chromosomes et de leur transmission dans les maladies génétiques humaines.- Comprendre les notions de génétique et d?évolution des populations humaines
Connaissances requises :

Programme :
CM :- Cytogénétique humaine : méthodes d?étude des chromosomes, classifications des chromosomes, anomalies chromosomiques, maladies génétiques.- Génétique et Evolution des Populations : Fréquences alléliques et génotypiques, modèle théorique de Hardy-Weinberg, stabilité et évolution de la diversité génétique, mécanismes et preuves de l?Evolution.TD :Exercices d?applications du coursTP :- Caryotype- Génétique des populations

Responsables :
Laurent DEBELLE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Philippe REGNAULT (Responsable) - département Mathématiques (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	TP	Total
Durée	12h	12h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	ITP	ITP	EOT	Total
		Durée	1h	1h	0h50
Points	Cas général	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
Prise en main du logiciel R pour la manipulation, la visualisation et la description de données.
Compétences spécifiques visées :
Maîtriser les bases du fonctionnement des logiciels R etR Studio et des outils de manipulation, de visualisation et d'analyse de données qu'ils proposent.
Compétences générales visées :
Apprendre à réaliser une étude descriptive d'une base de données avec un langage de programmation dédié.
Connaissances requises :
Notions de statistiques descriptives ( #NUM0301 )

Programme :
+ présentation du logiciel R (R Studio)+ fonctionnalité de bases et gestion des données+ manipulations et analyse descriptive des données

Responsables :
Jérôme CROUZET (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Maxime GOMMEAUX (Responsable) - département Sciences de la Terre (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	TP	Total
Durée	12h	12h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	CRTP	CRTP	Total
		Durée
Points	Cas général	1ère session	33	33	34	100%
		2ème session	33	33	34	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	33	33	34	100%
		2ème session	33	33	34	100%

Objectifs :
Présenter l?intérêt des méthodes informatiques comme système de calcul appliqué au traitement de données scientifiques et à l?assistance d?expérimentations (EXAO).
Compétences spécifiques visées :
Prise en main du matériel informatique (logiciels) et du matériel EXAO (consoles, adaptateurs, capteurs?)
Compétences générales visées :
Les 3 séances de Travaux Pratiques permettent d?étudier des exemples d?applications informatiques dans le domaine des Sciences de la Terre, de la Biologie Végétale et de la Biologie Animale.
Connaissances requises :
Maîtriser les notions de Sciences de la Terre, de la Biologie Végétale et de la Biologie Animale enseigné en 1ère année de licence

Programme :
Sciences de la Terre : notions sur les images numériques de la surface terrestre, visualisation et traitement d?images satellitales, analyse des unités de paysageBiologie Végétale : mise en évidence de l?influence de l?intensité de l?éclairement sur l?intensité de la photosynthèse à travers la mesure du dégagement d?O2Biologie Animale : mise en évidence de la respiration chez les organismes animaux et sa modulation par différents paramètres environnementaux

Responsables :
Annabelle BULIN (Responsable) - département Langues (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	TD	Total
Durée	12h	12h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	Oral	Projet	EOT	Total
		Durée	0h15	12h	0h15
Points	Cas général	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	0	40	60	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	60	40	0	100%
		2ème session	0	40	60	100%

Objectifs :

Consolider son niveau en langue anglaise.

Compétences spécifiques visées :

Travail approfondi en présentiel sur l?expression orale. Travail en autonomie sur les compétences de réception (compréhension de l?oral et de l?écrit), sur la grammaire, le vocabulaire et la phonologie.

Compétences générales visées :

Niveau B2 du cadre Européen Commun de Référence pour les Langues en fin de licence (compréhension de l?oral et de l?écrit, expression orale en continu et en interaction et expression écrite).
« Peut comprendre le contenu essentiel de sujets concrets ou abstraits dans un texte complexe, y compris une discussion technique dans sa spécialité. Peut communiquer avec un degré de spontanéité et d'aisance tel qu'une conversation avec un locuteur natif ne comportant de tension ni pour l'un ni pour l'autre. Peut s'exprimer de façon claire et détaillée sur une grande gamme de sujets, émettre un avis sur un sujet d?actualité et exposer les avantages et les inconvénients de différentes possibilités. »
Conseil de l'Europe (2001). Cadre européen commun de référence pour les langues ? Apprendre, enseigner, évaluer. Paris : Didier.

Connaissances requises :

Apprentissage de la langue anglaise dans l?enseignement secondaire et supérieur.

Programme :

Suite à son test de positionnement, l?étudiant travaillera en présentiel dans un groupe correspondant à son niveau et à ses objectifs de progression (travail vers B1, travail vers B2 ou travail vers C). 

Volume horaire non présentiel : En complément des TD, un travail en hors présentiel devra être effectué sur une plateforme de travail et/ou au Centre de Ressources en Langues (CRL), selon les consignes qui seront données par l'équipe pédagogique. Il représentera également un volume de 12h et sera inclus dans la note de projet.

Responsables :
Stéphanie SALESSE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Christelle OUDOT-DELACOUX (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	28h	20h	12h	60h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	DS	DS	DS	DS	EET	EET	Total
		Durée	1h			1h	0h30	2h	2h
Points	Cas général	1ère session	15	5	5	5	15	55	0	100%
		2ème session	0	0	0	0	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	0	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	0	0	0	100	100%

Objectifs :
Connaître la génétique des bactéries et des bactériophages. Comprendre la régulation de l?expression des gènes chez les procaryotes et leur fonction. Connaître les mécanismes moléculaires à l?origine des variations géniques.
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :

Connaissances requises :

Programme :
COURS? Parasexualité des Bactéries : Transformation, Conjugaison, Transduction.? Génétique des bactériophages. Recombinaison. Test de Complémentation. Notion de cistron, Régulation des cycles lytiques et lysogéniques.? Génétique moléculaire. Mutations géniques. Mutations chromosomiques. Recombinaison homologue? Régulation de l?expression des gènes bactériens : Opérons.? Mutants nutritionnels des Ascomycètes. Chaînes métaboliques.? Transposition.TRAVAUX DIRIGES? Application du coursTRAVAUX PRATIQUES? Génétique des Bactéries et des Bactériophages? Chaines métaboliques chez les levures

Responsables :
Aline BENNASROUNE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Amar BENNASROUNE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	18h	6h	6h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	EET	EET	Total
		Durée		1h30	1h30
Points	Cas général	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	40	0	60	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	40	0	60	100%

Objectifs :
Acquérir/approfondir les connaissances sur les différents mécanismes de la vie cellulaire (cycle cellulaire, mitose, mort cellulaire).Acquérir les bases de la culture in vitro de cellules animales (supports, milieux, conditions physico-chimique).Savoir définir une culture primaire et une lignée cellulaire.
Compétences spécifiques visées :
Savoir cultiver une lignée cellulaire.Quantifier la prolifération et la viabilité cellulaires.
Compétences générales visées :
Savoir restituer des résultats expérimentaux sous forme de compte-rendu.
Connaissances requises :
Connaissances générales en biologie cellulaire (programme de l'UE #BCPA0201 )

Programme :
COURS :Mécanismes de régulation du cycle cellulaire. La division cellulaire.Autophagie.Morts cellulaires.La culture in vitro de cellules animales : avantages, inconvénients, matériels, supports, milieux?Les cultures cellulaires (culture primaire, secondaire et lignées).TRAVAUX DIRIGES :Analyse d?articles et exercices sur des points précis évoqués lors des cours magistraux.TRAVAUX PRATIQUES :Introduction à la culture cellulaire et utilisation de techniques de quantification de la prolifération et de la viabilité cellulaire.

Responsables :
Angélique GAINVORS-CLAISSE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Sabine GOGNIES (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	14h	6h	10h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	ITP	CRTP	DS	EET	EET	Total
		Durée	0h15		1h	1h30	1h30
Points	Cas général	1ère session	10	20	20	50	0	100%
		2ème session	10	20	0	0	70	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	10	20	0	70	0	100%
		2ème session	10	20	0	0	70	100%

Objectifs :
Connaître les principaux groupes microbiens dans leur structure et mode de développement, avoir des notions de virologie humaine, appréhender les mécanismes de contrôle de la croissance bactérienne.
Compétences spécifiques visées :
Le programme vise à approfondir et élargir les connaissances de l?étudiant sur différents groupes microbiens, sur leurs structures et leurs modes de développement et leur impact sur l?Homme. D?autre part, il acquerra des notions de virologie humaine et sera par ailleurs apte à appréhender les mécanismes de contrôle de la croissance microbienne.
Compétences générales visées :
Regards critiques sur les résultats expérimentaux obtenus. Savoir organiser son travail expérimental pour une meilleure gestion du temps.
Connaissances requises :
Connaissances générales en microbiologie : notions développées dans les UE #MBIO0201 #MBIO0301 biologie cellulaire, génétique microbienne, biochimie et physique-chimie.

Programme :
COURS :? Bactériologie : Etude des biofilms (généralités, mise en place et organisation d?une communauté microbienne, moyens de lutte) - Sporulation chez les bactéries - Contrôle de la croissance microbienne - Antibiotiques antibactériens? Mycologie : Etude de champignons pathogènes pour l?Homme, mise en évidence et lutte.? Les virus : Etude des virus de cellules animales (classification, cycles de réplication, infections virales, production, antiviraux)TRAVAUX DIRIGES? Contrôle de l'activité des microorganismes? Titration d?un bactériophage (M13)? Préparation aux travaux pratiques et restitutionTRAVAUX PRATIQUES? Observation de micro-organismes (colorations simples et différentielles) et techniques de mises en culture.? Contrôle de la croissance des bactéries? Etude de la sporulation bactérienne? Titration d?un bactériophageAUTOFORMATION? Préparation des protocoles TP.? Recherches de compléments d?informations visant à expliquer le but des expérimentations et les résultats obtenus en vue de la rédaction descomptes rendus TP.

Responsables :
Stéphane DEDIEU (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Frédéric DELACOUX (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	28h	12h	20h	60h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	DS	CRTP	CRTP	CRTP	EET	EET	Total
		Durée	1h	1h				2h	2h
Points	Cas général	1ère session	15	15	6.66	6.67	6.67	50	0	100%
		2ème session	0	0	6.66	6.67	6.67	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	6.66	6.67	6.67	80	0	100%
		2ème session	0	0	6.66	6.67	6.67	0	80	100%

Objectifs :

« Du Gène à la Protéine : aspects mécanistiques chez les Eucaryotes »

Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :

Connaissances requises :

Il est recommandé d'avoir suivi au préalable #BM0401

Programme :

COURS :
- Réplication, et systèmes de réparation de l?ADN
- Transcription et Facteurs de transcription
- Traduction : mécanismes moléculaires, régulation et principales techniques d?étude
- Les différents systèmes protéolytiques intracellulaires
- Techniques d?étude des interactions protéine-protéine (GST- pull down, immunoprécipitation, double hybride) appliquées aux facteurs d?initiation de la traduction
- Techniques de mutagenèse dirigée

TD :
- Exercices d?application du cours et/ou analyse d?articles

TP :
- Clonage de gène dans plasmide d?expression procaryote/eucaryote
- Mise en évidence du transfert d?ADN étranger dans une bactérie par la technique de PCR
- Mutagenèse dirigée par PCR?

Responsables :
Franck DARGENT (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Katia SAVARY (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	30h	8h	22h	60h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CR	DS	EET	EOT	Total
		Durée		1h	2h	0h20
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	20	0	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%

Objectifs :
? Acquérir des connaissances sur différents aspects de la fonction de communication et d?intégration de l?information
Compétences spécifiques visées :
? Maîtriser la notion de système, ensemble d?organes assurant la même fonction, et savoir intégrer les différentes échelles d?étude d?un organisme animal? Savoir mettre en ?uvre un protocole expérimental assisté par ordinateur? Maitriser les bonnes pratiques en expérimentation animale dans le respect de l?éthique et de la législation
Compétences générales visées :
? Comprendre une démarche scientifique et expérimentale visant à répondre à une question concrète? Savoir analyser et interpréter des résultats expérimentaux.
Connaissances requises :
Physiologie de la nutrition animale #PHYA0301 Physiologie des cellules nerveuses et musculaires #PHYA0401

Programme :
Cours :? Pression artérielle et sa régulation? Fonction rénale et régulation? Régulations de la ventilation, de la digestion, de l?alimentation et homéostasie glucose? Motricité réflexe et volontaire? Fonctionnement des canaux ioniques et récepteurs cellulairesTravaux dirigés :? Exercices d?application du cours et compléments de coursTravaux pratiques :? Contrôle de la pression artérielle? Mesure du débit de filtration glomérulaire, du débit sanguin rénal et leur signification? Ventilation chez l?Homme? Absorption intestinale du glucose? Reflexe myotatique

Responsables :
Hélène BELLECAVE (Responsable) - département Langues (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	TD	Total
Durée	12h	12h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	IE	Projet	EET	Total
		Durée	0h40	12h	0h40
Points	Cas général	1ère session	50	50	0	100%
		2ème session	0	50	50	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	50	50	0	100%
		2ème session	0	50	50	100%

Objectifs :

Consolider son niveau en langue anglaise.

Compétences spécifiques visées :

Travail approfondi en présentiel sur l?expression écrite. Travail en autonomie sur les compétences de réception (compréhension de l?oral et de l?écrit), sur la grammaire, le vocabulaire et la phonologie.

Compétences générales visées :

Niveau B2 du cadre Européen Commun de Référence pour les Langues en fin de licence (compréhension de l?oral et de l?écrit, expression orale en continu et en interaction et expression écrite).
« Peut comprendre le contenu essentiel de sujets concrets ou abstraits dans un texte complexe, y compris une discussion technique dans sa spécialité. Peut communiquer avec un degré de spontanéité et d'aisance tel qu'une conversation avec un locuteur natif ne comportant de tension ni pour l'un ni pour l'autre. Peut s'exprimer de façon claire et détaillée sur une grande gamme de sujets, émettre un avis sur un sujet d?actualité et exposer les avantages et les inconvénients de différentes possibilités. »
Conseil de l'Europe (2001). Cadre européen commun de référence pour les langues ? Apprendre, enseigner, évaluer. Paris : Didier.

Connaissances requises :

Apprentissage de la langue anglaise dans l?enseignement secondaire et supérieur.

Programme :

Suite à son test de positionnement, l?étudiant travaillera en présentiel dans un groupe correspondant à son niveau et à ses objectifs de progression (travail vers B1, travail vers B2 ou travail vers C). 

Volume horaire non présentiel : En complément des TD, un travail en hors présentiel devra être effectué sur une plateforme de travail et/ou au Centre de Ressources en Langues (CRL), selon les consignes qui seront données par l'équipe pédagogique. Il représentera également un volume de 12h et sera évalué dans le cadre d?une note de projet.

Responsables :
Béatrice ROMIER-CROUZET (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Laurent DUCA (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	2h	6h	2h	10h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CRTP	EET	Total
		Durée		0h30
Points	Cas général	1ère session	100	0	100%
		2ème session	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	100	0	100%
		2ème session	0	100	100%

Objectifs :
Connaître et maîtriser en autonomie les principaux outils informatiques spécialisés dans les acides nucléiques. Présenter à l?oral un travail de recherche (TP) en anglais.
Compétences spécifiques visées :
Connaissances théoriques et pratiques de base en bioinformatique avec des applications potentielles dans les domaines de la Biologie et de la Biochimie
Compétences générales visées :

Connaissances requises :
Connaissances générales en Biologie Moléculaire et Biochimie

Programme :
Travaux pratiques (effectués en salle informatique) :Serveurs spécialisés dans l?analyse des séquences nucléotidiques (GenBank, dbEST, BLAST, OMIM, EMBL, Primer3?)Exercices d?application (identification/alignement de séquences, homologies) et en lien avec les travaux pratiques de Biologie Moléculaire (recherche et caractérisation d?amorces PCR, stratégies de clonage)

Responsables :
Sébastien ALMAGRO (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Laurent DEBELLE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	TP	Total
Durée	14h	14h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	OTP	ITP	EOT	Total
		Durée	0h50	1h	0h10
Points	Cas général	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
Savoir gérer et analyser des données en utilisant les statistiques descriptives.
Compétences spécifiques visées :
Statistiques descriptives. Logiciel R.
Compétences générales visées :
Programmation et gestion de scriptes dans R.
Connaissances requises :
Notions sur l?utilisation du logiciel R #MOI0401

Programme :
Travaux pratiques (7 séances de TP de 2h en salle informatique)+ rappels sur R et R Studio+ rappels sur la gestion de données et les fonctions usuelles de R+ variables aléatoires (couples de variables, variable centrée réduite)+ lois de probabilités+ échantillonnage et estimateurs+ intervalles de confiance+ initiation aux tests paramétriques

Responsables :
Christelle OUDOT-DELACOUX (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Stéphanie SALESSE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	28h	20h	12h	60h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	DS	DS	EET	EET	Total
		Durée	1h	1h	1h	1h	1h
Points	Cas général	1ère session	15	15	15	55	0	100%
		2ème session	15	15	15	0	55	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	15	85	0	100%
		2ème session	0	0	15	0	85	100%

Objectifs :
Appréhender l?étude des gènes eucaryotes et la régulation de leur expression
Compétences spécifiques visées :
Savoir réaliser une manipulation de transfection cellulaire suivie d?une extraction d?ARN et d?une RT-PCR et être capable d?analyser et de comprendre toutes les étapes ainsi que les résultats obtenus.
Compétences générales visées :

Connaissances requises :
Il est recommandé de connaître les mécanismes qui mènent du gène à la protéine #GENM0201 et la biologie moléculaire de la cellule eucaryote #BM0501

Programme :
CM :? Technologies autour de l?ADN recombinant : les endonucléases de restriction, le clonage des gènes, les banques d?ADN.? Structure morcelée des gènes eucaryotes. Familles multigéniques. Séquences répétitives dans un génome. Empreintes génétiques? Transfection et transgénèse animale? Régulation de l?expression des gènes eucaryotes : mécanismes moléculaires et principales techniques d?étude- Régulations transcriptionnelles et post-transcriptionnelles- Mécanismes épigénétiques- Les ARN régulateursTD-Cartographie de gènes par utilisations des enzymes de restrictions, exercices de manipulation de l?ADN, étude de la structure d?un gène-Analyse d?articles scientifiques sous forme de présentation oraleTP? Cartographie par des enzymes de restriction? Transfection de cellules eucaryotes à l?aide de plasmides codant pour des protéines de fusion fluorescentes, extraction d?ARN, RT-PCR

Responsables :
Sébastien BLAISE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Franck DARGENT (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	6h	8h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	CR	DS	EET	EOT	Total
		Durée		1h	2h	0h20
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	20	0	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	0	100	100%

Objectifs :
? Acquérir des connaissances sur différents aspects de la fonction de communication neuro-endocrine en réponse à des variations de l?environnement
Compétences spécifiques visées :
? Maîtriser la notion de système, ensemble d?organes assurant la même fonction, et savoir intégrer les différentes échelles d?étude d?un organisme animal? Savoir mettre en ?uvre un protocole expérimental assisté par ordinateur? Maitriser les bonnes pratiques en expérimentation animale dans le respect de l?éthique et de la législation
Compétences générales visées :
? Comprendre une démarche scientifique et expérimentale visant à répondre à une question concrète? Savoir analyser et interpréter des résultats expérimentaux.
Connaissances requises :
Physiologie des cellules nerveuses et musculaires #PHYA0401 Physiologie de la nutrition animale #PHYA0301

Programme :
Cours :? Physiologie du stress et pathologies? Thermorégulation? Communication hormonaleTravaux dirigés :? Exercices d?application du cours et compléments de coursTravaux pratiques :? Evaluation comportementale de l?anxiété? Variation de pression artérielle en situation de stress? Thermorégulation.

Responsables :
Jérôme DEVY (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	18h	4h	8h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	OTP	DS	EET	EET	Total
		Durée	0h30	0h30	2h	2h
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	20	0	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	20	0	0	80	100%

Objectifs :
Comprendre et connaitre les différents systèmes qui composent un organisme et l?organisation tissulaire.Connaitre les différents types de cellules souches et comprendre les mécanismes de différentiations qui aboutissent à la formation des différents tissus.Connaitre et comprendre les relations intercellulaires
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :

Connaissances requises :

Programme :
Cours :- Histologie (définition des systèmes et organisation tissulaire)- Les cellules souches / la différentiation cellulaire (les tissus épithéliaux / le tissu mésenchymateux)- Les relations intercellulaires ( la matrice extracellulaire / les molécules d?adhérence )- La transition épithélio-mésenchymateuse.TD :Application du coursTP :Molécules d?adhérence cellulaire et matrice extracellulaire(Test d?adhérence et de migration cellulaire)

Responsables :
Stéphanie SALESSE (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Stéphane DEDIEU (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	Total
Durée	20h	10h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	Oral	EET	EET	Total
		Durée	1h	2h	2h
Points	Cas général	1ère session	40	60	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
connaitre les outils moléculaires et cellulaires utilisés dans les approches de Thérapies cellulaire et génique. Comprendre les buts et principes des thérapies cellulaire et génique à travers divers exemples d?applications cliniques.
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :

Connaissances requises :

Programme :
CM :? La thérapie génique :-Principe et buts de la thérapie génique-Les vecteurs utilisés en thérapie génique-Les applications cliniques de la thérapie génique : exemples d?applications? La thérapie cellulaire- Principe et buts de la thérapie cellulaire- Les Cellules utilisées en thérapie cellulaire- Les applications cliniques de la thérapie cellulaire: exemples d?applications-Utilisation des cellules souches en thérapie cellulaireTD- travail en groupe pour l?analyse d?articles scientifiques et la présentation de projets en lien avec les notions développées en cours.

Responsables :
Stéphane DEDIEU (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Frédéric DELACOUX (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	Total
Durée	22h	8h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	Oral	EET	EET	Total
		Durée	1h	2h	2h
Points	Cas général	1ère session	50	50	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	100	0	100%
		2ème session	0	0	100	100%

Objectifs :
Appréhender les nouvelles approches biotechnologiques utilisées lors du diagnostic et/ou du traitement de pathologies humaines
Compétences spécifiques visées :

Compétences générales visées :
Recommandé pour les Master en Biologie-Santé
Connaissances requises :

Programme :
COURS :- Les sociétés de biotechnologie- Les nouvelles stratégies chimiothérapeutiques et les approches combinatoires associées- Ingénierie moléculaire- L?immunothérapie cellulaire : utilisation d?anticorps monoclonaux et stratégies de vaccination- Les nanobiotechnologies- Essais cliniques et brevets- Clonage Thérapeutique et BioéthiqueTD :- Groupes de discussion et brainstorming en rapport avec des sujets d?actualités relatifs aux biotechnologies.- Etude de cas : création d?une start-up (travail en groupe et présentation d?un projet)

Responsables :
Michel TARPIN (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	10h	4h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	CRTP	EET	EET	Total
		Durée	1h		1h	1h
Points	Cas général	1ère session	30	10	60	0	100%
		2ème session	0	10	0	90	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	10	90	0	100%
		2ème session	0	10	0	90	100%

Objectifs :
L?étude génétique du développement conduit à des retombées importantes et multiples dans les domaines de la recherche médicale et agronomique, fondamentale et appliquée (recherche sur le cancer, amélioration des plantes et des animaux). Le but de cet enseignement est de présenter les concepts et les méthodes utilisées dans l?analyse génétique et moléculaire du développement et de montrer les avancées permises par la connaissance des génomes et de faire approcher aux étudiants l?expression des gènes comme un système dynamique et modulable (espace, temps, environnement) parfaitement codifié.
Compétences spécifiques visées :
Bases cellulaires et moléculaires nécessaires à la bonne compréhension des processus biologiques vus tant du point de vue de la Génétique que de la Biologie du Développement.
Compétences générales visées :
Montrer que l?étude génétique du développement conduit à des retombées importantes et multiples dans les domaines de la recherche médicale et agronomique, fondamentale et appliquée (recherches sur le cancer, amélioration des plantes et des animaux).
Connaissances requises :

Programme :
CM :- Introduction, généralités, techniques et concepts de base en Biologie du Développement- Présentation des systèmes modèles en Biologie du développement (Invertébrés, vertébrés, Plantes)- La construction du plan d?un organisme : mise en place des axes du corps. Contrôle génétique du développement : Les gènes maternels, l?expression du génome embryonnaire, les gènes homéotiques dans la signalisation cellulaire.- De la mouche à l?Homme un même super gène pour l??il.- Développement du membre du tétrapode : l?origine des doigts.- La formation et la régionalisation des somites.TD :Exercices d?applications du coursTP :- Biologie et Génétique du Développement des Invertébrés (Drosophile, oursin, ?)- Biologie et Génétique du Développement des Vertébrés (Xénope, souris, ?)

Responsables :
Michel TARPIN (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Bertrand BRASSART (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	8h	6h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	CRTP	EET	EET	Total
		Durée	1h		2h	2h
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	0	20	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	20	80	0	100%
		2ème session	0	20	0	80	100%

Objectifs :

Compétences spécifiques visées :
Comprendre la mécanistique et la régulation des mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans les réponses immunitaires spécifiques.
Compétences générales visées :
Recueillir, analyser et exploiter des résultats scientifiques, préparer pour un master
Connaissances requises :

Programme :
CM :- L?Immunité à médiation humorale : vie et mort des cellules B (développement, activation, différenciation et mémoire)- L?immunité à médiation cellulaire : vie et mort des cellules T (développement, activation, différenciation et mémoire)- Les réponses effectrices : l?immunité effectuée par les cellules et les anticorps- La réponse immunitaire dans l?espace et dans le temps- Le système immunitaire chez l?Homme sain et l?Homme malade : Tolérance, autoimmunité et greffeTD :Exercices d?applications du cours : L?immunité à médiation humorale et l?immunité à médiation cellulaireTP :- Etude de l?activité hémolytique du complément et de la bi-fonctionnalité des anticorps par différentes approches expérimentales (agglutination, hémolyse, immunohistochimie, ?).

Responsables :
Michel TARPIN (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	10h	4h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	CRTP	EET	EET	Total
		Durée	1h		1h	1h
Points	Cas général	1ère session	30	10	60	0	100%
		2ème session	0	10	0	90	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	10	90	0	100%
		2ème session	0	10	0	90	100%

Objectifs :
L?étude génétique du développement conduit à des retombées importantes et multiples dans les domaines de la recherche médicale et agronomique, fondamentale et appliquée (recherche sur le cancer, amélioration des plantes et des animaux). Le but de cet enseignement est de présenter les concepts et les méthodes utilisées dans l?analyse génétique et moléculaire du développement et de montrer les avancées permises par la connaissance des génomes et de faire approcher aux étudiants l?expression des gènes comme un système dynamique et modulable (espace, temps, environnement) parfaitement codifié.
Compétences spécifiques visées :
Bases cellulaires et moléculaires nécessaires à la bonne compréhension des processus biologiques vus tant du point de vue de la Génétique que de la Biologie du Développement.
Compétences générales visées :
Montrer que l?étude génétique du développement conduit à des retombées importantes et multiples dans les domaines de la recherche médicale et agronomique, fondamentale et appliquée (recherches sur le cancer, amélioration des plantes et des animaux).
Connaissances requises :

Programme :
CM :- Introduction, généralités, techniques et concepts de base en Biologie du Développement- Présentation des systèmes modèles en Biologie du développement (Invertébrés, vertébrés, Plantes)- La construction du plan d?un organisme : mise en place des axes du corps. Contrôle génétique du développement : Les gènes maternels, l?expression du génome embryonnaire, les gènes homéotiques dans la signalisation cellulaire.- De la mouche à l?Homme un même super gène pour l??il.- Développement du membre du tétrapode : l?origine des doigts.- La formation et la régionalisation des somites.TD :Exercices d?applications du coursTP :- Biologie et Génétique du Développement des Invertébrés (Drosophile, oursin, ?)- Biologie et Génétique du Développement des Vertébrés (Xénope, souris, ?)

Responsables :
Michel TARPIN (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)
Bertrand BRASSART (Responsable) - département Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Volume horaire :

Nature	CM	TD	TP	Total
Durée	16h	8h	6h	30h

Modalités de contrôle des connaissances :

Épreuves		Nature	DS	CRTP	EET	EET	Total
		Durée	1h		2h	2h
Points	Cas général	1ère session	20	20	60	0	100%
		2ème session	0	20	0	80	100%
	Dispense contrôle continu	1ère session	0	20	80	0	100%
		2ème session	0	20	0	80	100%

Objectifs :

Compétences spécifiques visées :
Comprendre la mécanistique et la régulation des mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans les réponses immunitaires spécifiques.
Compétences générales visées :
Recueillir, analyser et exploiter des résultats scientifiques, préparer pour un master
Connaissances requises :

Programme :
CM :- L?Immunité à médiation humorale : vie et mort des cellules B (développement, activation, différenciation et mémoire)- L?immunité à médiation cellulaire : vie et mort des cellules T (développement, activation, différenciation et mémoire)- Les réponses effectrices : l?immunité effectuée par les cellules et les anticorps- La réponse immunitaire dans l?espace et dans le temps- Le système immunitaire chez l?Homme sain et l?Homme malade : Tolérance, autoimmunité et greffeTD :Exercices d?applications du cours : L?immunité à médiation humorale et l?immunité à médiation cellulaireTP :- Etude de l?activité hémolytique du complément et de la bi-fonctionnalité des anticorps par différentes approches expérimentales (agglutination, hémolyse, immunohistochimie, ?).