CHPS1002 - Eléments de chimie théorique ; HPC pour la chimie

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  • Équipe pédagogique

    • Responsables

    • BOISSON Jean-Charles (Responsable)
      Département : Informatique (UFR SEN)
    • HENON Eric (Coresponsable)
      Département : Chimie (UFR SEN)
  • Volume horaire

  • Nature CMTP Total
    Durée 12h8h20h
  • Modalités de contrôle des connaissances (MCC)

  • Epreuves Nature CRTPDSTEOT Total
    Durée 2h0h30
    Cas général 1ère session 4060 100%
    2nd session 4060 100%
    Dispense contrôle continu 1ère session 4060 100%
    2nd session 4060 100%
  • Modalités de contrôle des connaissances (MCC)

  • Cas général

  • Nature Durée 1ère session 2ème session
    CRTP 40% 40%
    DST 2h 60% 0%
    EOT 0h30 0% 60%
  • Dispense contrôle continu

  • Nature Durée 1ère session 2ème session
    CRTP 40% 40%
    DST 2h 60% 0%
    EOT 0h30 0% 60%
  • Objectifs

  • Acquérir une base minimale de connaissances sur les algorithmes majeurs rencontrés dans les méthodes de la Chimie théorique, en particulier en Chimie quantique

  • Compétences spécifiques visées

    • Comprendre les concepts de Chimie théorique et les grandes lignes d’une simulation moléculaire quantique sur des ressources HPC
    • Connaître la notion de densité électronique et son exploitation en vue d’identifier et quantifier les interactions chimiques au sein des systèmes moléculaires
    • Savoir programmer en Fortran (langage rencontré en majorité dans ce domaine)
  • Compétences générales visées

  • Acquérir les éléments nécessaires pour un travail à l’interface Chimie théorique – Informatique

  • Connaissances requises

  • Niveau de Terminale en Chimie (atome, électron). Niveau 1er cycle scientifique en Mathématiques (diagonalisation de matrice, vecteur propre, déterminant, opérateur).

  • Programme

    • Langage Fortran :
      • les bases du langage
      • spécificités du langage dans le cadre du HPC (stockage mémoire, parallélisation OpenMP, …)
    • Surface d’Énergie Potentielle (SEP) : gradient, point stationnaire, point selle d’ordre 1 et liens en Chimie
    • Notion centrale d’orbitale en Chimie quantique
    • Notion de densité électronique : calcul et exploitation
    • Mises en oeuvre à travers le logiciel IGMPlot
      • installation du paquet
      • notions d’input/ouput
        • logiciel associé de post-visualisation des résultats (VMD)