• Responsables

• DEBELLE Laurent (Responsable)

  Département : Biologie-Biochimie (UFR SEN)

Visualiser et manipuler les molécules biologiques en vue de mieux comprendre leurs relations structure-fonction.
Savoir produire une représentation moléculaire explicative de la fonction d’une molécule biologique.
Connaître les principales banques de données biologiques et les logiciels permettant de les exploiter.

Connaître les structures des bases de données biologiques.
Savoir utiliser le logiciel VMD et ses principaux outils de visualisation et d’analyse.
Maîtriser les outils d’alignement et de comparaison de séquences.

Travailler avec soin et rigueur.
Avoir des savoir-faire techniques et des méthodes de travail.
Savoir restituer des résultats expérimentaux sous forme de compte-rendu.
Maitriser la communication scientifique.
Anglais technique et programmation de fonctions simples.

Connaissances de bases sur la nature des molécules biologiques et leurs structures (biochimie)

COURS (8h) :
• Données numériques en biologie (nature et principaux serveurs) 2h
• Analyses de séquences (profils d’index, prédictions, modes de représentation) 2h
• Alignement de séquences (algorithmes, matrices, BLAST, ClustalW) 2h
• Modélisation et graphisme moléculaires (principes, nomenclatures, outils) 2h

TRAVAUX DIRIGES (8h) :
• Analyses de séquences 2h
• Alignement de séquences 2h
• Modélisation/graphisme, exemple 1 à définir 2h
• Modélisation/graphisme, exemple 2 à définir 2h

TRAVAUX PRATIQUES (10h) :
• Applications dans le domaine des agroressources 2 x 2h
• Applications dans le domaine de la santé 2 x 2h
• Applications dans le domaine de l’environnement 1 x 2h